1、物流业分布不均衡
总体上来说，我国物流业大部分分布在东部沿海地区，而中西部地区的物流业发展相对比较落后，尤其是新疆、西藏、甘肃、云南等地区。2017 年，从快递业务收入上来看，东中西部的比重分别为 82.3%、9.3%、8.4%，从业务量上看东中西部比重分别为81.9%、10.5%、7.6%，从这些数据来看，东中西部差距显著，这体现出物流业的发展明显不合理。
2、从业人员素质不高
（1）教育程度不高。目前，我国大部分从事物流行业的员工接收教育的程度普遍不高，只有相当的技术却没有掌握相关现代物流业的专业知识。我国部分物流企业的大多数员工是从事传统运输业的人员，接受教育的程
（2）从业人员服务意识差，流动性较大。受教育程度的影响，我国物流行业大部分员工整体素质不高，没有良好的服务意识和态度。尤其是快递人员，不能在执行工作效率的同时照顾到服务态度，这使得消费者对快递业的服务成都较低。主要原因在于快递人员的快递随意丢方甚至损坏丢失而应对态度差等等。
我国物流行业的从业人员流动性比较大，影响企业的稳定性，增加企业的成本，阻碍企业的发展。造成这一局面的原因较多，其主要因素是收入待遇水平低、工作压力过大、缺乏晋升空间、学习和发展机会少。
3、物流成本较高
（1）运输和仓储成本占有比重高。物流行业的成本在于交通运输成本、仓储保管成本、配送成本、管理成本等等，其中交通运输成本占有的比重最高，如高速费、油费、港口使用费等费用。
仓储保管成本是紧随交通运输成本后的又一项重要支出，首先，土地资源稀缺、价格高，增加了仓储保管费用，仓储用地申请难，仓储地点分散杂乱，没有较好的规划，相互之间不能统一协调，无形之中增加了仓储成本。
（2）税负较重。在我国企业除了要交纳所得说，还要缴纳流转税、土地使用税、城市维护建设税及教育费附加等各种税费。物流业在营改增之前缴纳营业税，不同的业务适用不同的营业税的税目，其对应的税率有所不同，各个环节按对应的税目征税，税率可能不相同，税种多、税负重，这也加重了物流企业的税收负担。
（3）技术水平落后。现代物流业与以前相比更加重视技术和管理，然而目前，我国的大多数物流企业采用传统的运作方式，科学技术应用较少，信息化程度不高，还不能广泛的使用物流信息系统、电子数据交换技术和货物跟踪系统等先进的技术，信息传输的速度和准确性得不到较大提高，进一步影响对单据处理成本、库存成本、差错成本、人事成本等的有效控制。
4、物流业管理不规范
虽然我国的物流行业发展迅速，物流企业较多，但是大多规模较小且比较散乱，没有形成统一规范的标准，物流市场比较混乱，还不能形成规范化的经营，而且物流业的管理部门也比较散乱，没有明确的管理负责部门，有些政策是相互冲突的，这都使得物流行业处于管理不规范的状态。